1978年，宋任穷从七机部调任为中组部部长，这一角色的转换对他来说几乎是一个意外的宣告。他内心感到震惊，并且未做充分的心理准备，心中充满了些许犹豫与不安。面对这样的局面，上级给予他的指导非常明确：不必再犹豫，迅速接受这一任命，开始新的工作。

对于中组部所承担的职责，宋任穷并非毫无经验可言。早在1946年，他便被任命为晋冀鲁豫中央局组织部部长，主导干部的组织和任免工作，整整两年之久，直至1948年调任至豫苏皖中央分局，负责地方具体事务。1954年，他完成了从西南局到北京的调任，先后担任了中央副秘书长、中组部副部长和总干部部副部长。在这些角色中，他的工作主要是协助老一辈领导人邓小平，但由于罗荣桓的请求，他转而进入军队，专门负责干部的任用与管理，这一职务在中组部实际上只是一个挂职的性质。

此后，宋任穷逐渐升任为二机部部长和东北局书记，承载着越来越多的责任。可惜的是，之后他又经历了一段长达十年的工作中断。能够被任命为中组部部长，宋任穷身上有着诸多因素的加持。

首先，他的组织协调能力非常突出，这一能力源自于他在战争年代长期在地方开辟和巩固根据地的经历，同时也包括他在干部任免工作中积累的丰富经验。当时，中组部主要负责对历史冤屈的平反，而在担任七机部部长期间，宋任穷曾大力推动过七机部的整顿工作。七机部作为承担国家航天工业发展的关键单位，当时面临的紧迫任务是确保洲际导弹在1980年前进行试射，这项工作压力巨大。1975年，国防科委主任张爱萍进行过一次大规模的整顿，使七机部恢复正常运作，然而一些造反派的持续干扰又使张爱萍陷入到二次被动的境地。

1977年，张爱萍重返工作岗位，上级许可他选择合作伙伴以及领导班子。在这一过程中，他意外选择了已经十年未曾工作的宋任穷担任七机部部长。上任后，宋任穷深入了解七机部的运作情况，发现其科研生产情况已数次接近瘫痪。经过七个月的努力，他细致工作，需对京单位600多名清查对象作出结论，逐渐恢复了科研生产的正常秩序，并对七机部冤假错案的440个案件进行了复查与平反，基本得以解决。

在顺利解决七机部问题后，1978年12月，宋任穷参与了十一届三中全会，随即被任命为中组部长。尽管他认为这个职务的分量重大，也自觉能力不足，缺乏充分的果敢与决断，但从外界来看，他的谦虚显得有些过于低调。他在这一位置上工作了四年多，主要任务是平反历史冤假错案，中组部直接办理和复查了130多名副省长、副部长级干部的重大案件。

经过三年的不懈努力，到1982年底，宋任穷已基本完成了平反冤假错案的任务，复查和平反了230万人的案件。到了1985年，七十多岁的宋任穷逐渐感到力不从心，于是他主动提出退居二线，希望将这个重要的位置让给年轻一代干部，继续为国家的发展添砖加瓦。